Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bco2Q99NF1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bco2Q99NF1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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