Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mccc1Q99MR8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mccc1Q99MR8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms