Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp1b4Q99ME6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1b4Q99ME6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1b4Q99ME6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms