Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdpd3Q99LY2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms