Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnpo2Q99LG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnpo2Q99LG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms