Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmed9Q99KF1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed9Q99KF1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms