Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vwa5aQ99KC8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vwa5aQ99KC8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vwa5aQ99KC8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms