Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdcbp2Q99JZ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdcbp2Q99JZ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdcbp2Q99JZ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdcbp2Q99JZ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdcbp2Q99JZ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms