Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SptssbQ925E8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms