Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim7Q923T7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim7Q923T7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim7Q923T7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim7Q923T7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim7Q923T7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim7Q923T7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim7Q923T7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms