Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b3Q921M3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b3Q921M3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms