Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msi2Q920Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msi2Q920Q6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms