Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HlcsQ920N2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HlcsQ920N2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HlcsQ920N2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HlcsQ920N2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HlcsQ920N2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HlcsQ920N2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HlcsQ920N2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms