Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atl3Q91YH5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atl3Q91YH5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atl3Q91YH5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atl3Q91YH5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms