Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha12Q91Y18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha12Q91Y18 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha12Q91Y18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms