Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrl3Q91VW3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrl3Q91VW3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms