Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hps3Q91VB4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hps3Q91VB4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms