Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms