Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4cQ8VCD7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4cQ8VCD7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm4cQ8VCD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms