Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ApobrQ8VBT6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ApobrQ8VBT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms