Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmx1Q8VBT0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmx1Q8VBT0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmx1Q8VBT0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmx1Q8VBT0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmx1Q8VBT0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms