Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim29Q8R2Q0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim29Q8R2Q0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim29Q8R2Q0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms