Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r212Q8R268 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r212Q8R268 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms