Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg10Q8R1P4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg10Q8R1P4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg10Q8R1P4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms