Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms