Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxn4Q8K3Q3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Foxn4Q8K3Q3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms