Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sash3Q8K352 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sash3Q8K352 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sash3Q8K352 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms