Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ssh3Q8K330 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ssh3Q8K330 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ssh3Q8K330 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ssh3Q8K330 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms