Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn1Q8K129 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn1Q8K129 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctxn1Q8K129 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn1Q8K129 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn1Q8K129 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn1Q8K129 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctxn1Q8K129 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctxn1Q8K129 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctxn1Q8K129 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms