Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbrd1Q8K0B2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd1Q8K0B2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd1Q8K0B2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms