Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LgsnQ8CIX8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LgsnQ8CIX8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LgsnQ8CIX8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms