Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rftn2Q8CHX7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn2Q8CHX7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rftn2Q8CHX7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms