Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Snx8Q8CFD4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms