Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA2

Amt, Aminomethyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmtQ8CFA2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmtQ8CFA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmtQ8CFA2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms