Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo43Q8CDI2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo43Q8CDI2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo43Q8CDI2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo43Q8CDI2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo43Q8CDI2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo43Q8CDI2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms