Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A430089I19RikQ8C9W1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A430089I19RikQ8C9W1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms