Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsr2Q8C8T8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsr2Q8C8T8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms