Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
N4bp3Q8C7U1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
N4bp3Q8C7U1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
N4bp3Q8C7U1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms