Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp20Q8C6M1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp20Q8C6M1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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