Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfrp1Q8C4U3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sfrp1Q8C4U3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms