Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssuh2Q8C3L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssuh2Q8C3L1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms