Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim35Q8C006 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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