Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TtpaQ8BWP5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtpaQ8BWP5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms