Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc122Q8BVN0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc122Q8BVN0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms