Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan12Q8BKT6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan12Q8BKT6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan12Q8BKT6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms