Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnrc6bQ8BKI2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnrc6bQ8BKI2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms