Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf41Q8BH75 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf41Q8BH75 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf41Q8BH75 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms