Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubash3bQ8BGG7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubash3bQ8BGG7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubash3bQ8BGG7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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