Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl2Q8BG73 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms