Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc12Q80WJ6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcc12Q80WJ6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc12Q80WJ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms